Генетика вирусов гриппа - Пейлиз П. - Практическое пособие

Год выпуска: 1986

Автор: Пейлиз П., Кингсбери Д. У.

Жанр: Микробиология

Формат: DjVu

Качество: Отсканированные страницы

Описание: В практическом пособии «Генетика вирусов гриппа» рассмотрены генетика и молекулярные основы репродукции вируса гриппа, его эволюция и эпидемиология. В книге описаны геном вируса гриппа, транскрипция генома и геномные РНК-сегменты. В книге «Генетика вирусов гриппа» представлены данные об антигенной вариации и мутантах вирусов гриппа, экспрессии клонированных генов, генетическом базисе вирулентности вируса. В книге «Генетика вирусов гриппа» освещены наиболее крупные пандемии XX века.

Книга «Генетика вирусов гриппа» предназначена для микробиологов, эпидемиологов, вирусологов, генетиков.

Содержание книги

«Генетика вирусов гриппа»

Перспективы развития генетики вируса гриппа — Э. Кильбурн (Е. Kilbourne)
II. Развитие современной генетики вируса гриппа
A. Первые лабораторные доказательства генетической изменчивости
Б. Применение традиционных генетических методов для изучения вируса гриппа
B. Генетические маркеры
Г. Развитие методов бляшек
Д. Использование условных летальных мутантов

Е. Новые подходы в генетике вируса гриппа
1. Биохимическая идентификация продуктов вирусного гена при нечетком определении вирусного потомства
2. Картирование генома вируса гриппа коррелятивными физико-химическими и биологическими методами
3. Применение методов молекулярной биологии для изучения вирусных генетических изменений
4. Олигонуклеотидное картирование вирусных РНК
5. Роль секвенирования белка и РНК в генетике вируса гриппа — внутригенное картирование
III. Вирусная генетика и понимание вирулентности и патогенно-сти вирусов
IV. Взаимосвязь генетики вируса гриппа с эпидемиологией и эволюцией вирусов гриппа (молекулярная эпидемиология)
A. Генетическое перераспределение в природе и его роль в эволюции новых вирусов
Б. Генетика минорной изменчивости
B. Вирусы гриппа А, В и С
V. Практическое применение генетики вируса гриппа
VI. Специальная генетика вирусов с раздробленным геномом в связи с проблемами гриппа
VII. Нерешенные проблемы гриппа и генетические подходы к их решению
Сегменты РНК вируса гриппа и кодированные ими белки — Р. Лемб (R. Lamb)
II. Частица вируса гриппа: основная структура
III. Структура генома
А. Первые доказательства сегментированности генома
Б. Восемь сегментов РНК вируса гриппа
В. Методы определения функций гена
Г. Последовательности 5- и З-концов каждого сегмента РНК— общие
Д. Синтез двунитчатой ДНК с РНК вируса гриппа, клонирование и определение нуклеотидных последовательностей

IV. Сегменты РНК вируса гриппа
A. Сегменты 1, 2 и 3 РНК: свойства белков РВ1, РВ2 и РА, ассоциированных с транскриптазой
Б. Сегмент 4 РНК: структура и функция гемагглютинина
1. Структура сегмента 4 РНК, кодирующего гемагглютинин
2. Трехмерная структура гемагглютинина
3. Синтез гемагглютинина. котрансляционные и посттрансляционные модификации
4. Активация инфекционности кливеджем и слияние in vitro
B. Сегмент 5 РНК: структура белка нуклеокапсида
Г. Сегмент 6 РНК: структура и свойства нейраминидазы

Д. Сегмент 7 РНК: структура и синтез мембранного белка (Ml) и неструктурного белка (М2)
Е. Сегмент 8 РНК: структура и синтез неструктурных белков NS1 и NS2
Ж. Перекрывающиеся кодирующие области, использующие различные рамки считывания у вирусов
Транскрипция и репликация вируса гриппа — Р. Краг (R. Krug)
И. Синтез вирусных мРНК
A. Праймирование клеточными кэппированными РНК— открытие
Б. Праймирование клеточными кэппированными РНК — механизм
B. Роль трех вирусных белков Р на этапах праймирования транскрипции
Г. Окончание транскрипции и добавление поли (А)
Д. Регуляция синтеза вирусной мРНК в инфицированной клетке
Е. Клеточный сайт для синтеза вирусных мРНК
Ж. Роль других функций ядер клеток-хозяев в синтезе вирусной мРНК — сплайсирование и метилирование внутренних А-остатков
III. Синтез транскриптов во всю длину
IV. Синтез вРНК (репликация)
Генетическое родство вирусов гриппа (РНК и белок) — К. Шолтиссек (С. Scholtissek)
И. Генетическое родство вирусных РНК
A. Различия в скоростях миграции As сегментов РНК, выявленные методом электрофореза в полиакриламидном геле (ПААГЭ)
Б. Молекулярная гибридизация
1. Прямая. РНК-РНК-гибридизация
2. Конкурентная гибридизация
3. ДНК-РНК-гибридизация
4. Анализ двухцепочечных обработанных нуклеазой S1 гибридных молекул методом ПААГЭ
B. Метод олигонуклеотидного фингерпринта
Г. Секвенирование сегментов РНК
1. Секвенирование 32Р-концевых меченых РНК частичным расщеплением нуклеазой
2. Секвенирование З-конца РНК с использованием дидеокси-метода
3. Секвенирование полных сегментов РНК
а) Ген гемагглютинина
б) Ген нейраминидазы
в) Три гена белка Р
г) Ген нуклеопротеида
д) Ген мембранного белка
е) Ген неструктурного белка
III. Генетическое родство вирусных белков
A. Различия в скоростях миграции вирусных белков при ПААГЭ

Б. Триптическое пептидное картирование
B. Прямое секвенирование
Антигенные вариации среди вирусов гриппа типа А — Р. Вебстер, В. Лейвер, Г. Эйр (R. Webster, W. haver, G. Air)
II. Исторические сведения
III. Номенклатура
IV. Химические и физические свойства антигенов
V. Гемагглютинин
A. Выделение и антигенные свойства гемагглютинина
Б. Изменение структуры и антигенности гемагглютинина при низких значениях рН
B. Антигенный дрейф гемагглютинина
Г. Использование моноклональных антител в анализе антигенного дрейфа
Д. Изменение последовательности гемагглютинина вариантов вируса гриппа, отобранных с моноклональными антителами
Е. Расположение антигенных сайтов в 3-D структуре гемагглютинина
Ж. Отбор антигенных вариантов секвенированием
3. Антигенный дрейф гемагглютинина вируса гриппа типа А низших животных
VI. Нейраминидаза
A. Антигенные вариации в нейраминидазе
Б. Селекция вариантов нейраминидазы с моноклональными антителами
B. Антигенный дрейф в нейраминидазах вирусов гриппа типа А низших животных
Г. Механизм антигенного дрейфа
VII. Антигенный шифт
А. Выводы из анализа последовательностей
Б. Возможные механизмы шифтов в штаммах вируса гриппа человека
В. Антигенный среди вирусов гриппа низших животных
VIII. Вариация в нуклеопротеиде
IX. Вариация в матриксном белке
X. Вариация в неструктурных белках
XI. Вариации в белках полимеразы
XII. Каково будущее?
Экспрессия клонированных генов вируса гриппа — М.Дж Гетсинг Дж. Сэмбрук (M.J. Gething, J. Sambrook)
II. Векторы экспрессии
III. Экспрессия генов вируса гриппа в Е. coli
А. Экспрессия гемагглютинина
Б. Экспрессия белка NS1
IV. Экспрессия генов вируса гриппа в клетках эукариотов
A. Экспрессия гемагглютинина в клетках обезьян с использованием рекомбинантных SV40 вирусных векторов
B. Приготовление генов гемагглютинина
В. Конструирование рекомбинантных геномов
Г. Введение рекомбинантных геномов в клетки обезьян и продукция вирусного материала
Д. Анализ гемагглютинина экспрессированного из SV40-HA-рекомбинантных векторов
Е. Количественная оценка гемагглютинина, экспрессированного из рекомбинантных геномов
Ж. Влияние промежуточных последовательностей в транскрипте гемагглютинина рекомбинанта на уровень экспрессии белка гемагглютинина
3. Экспрессия матриксного гена в клетках обезьян с использованием SV40-M-рекомендованнoro вируса
И. Кратковременная экспрессия клонированных генов в клетках COS-1
К. Непрерывная экспрессия гемагглютинина из генов, интегрированных в хромосомы клеток эукариотов
V. Анализ экспрессии белков мутанта гемагглютинина
А. Сигнал-минус гемагглютинина (S_HA) — негликозилированный внутриклеточный белок
Б. Удаление С-терминальной гидрофобной последовательности превращает гемагглютинин в секретированный белок
В. Планы на будущее
Мутанты вируса гриппа — Б. Мэйхи (В. Mahy)
II. Характеристика вирусных мутантов
A. Системы вирус гриппа—клетка
Б. Природа вирусной популяции
B. Скорость естественной мутации
Г. Индукция мутантов
1. Мутагены
Д. Текучесть и реверсия
III. Температурочувствительные мутанты
A. Генетическое взаимодействие и классификация мутантов

Б. Передача ts-повреждений индивидуальным сегментам генома
1. Мутанты из Кембриджа
2. Мутанты из Нью-Йорка и Токио
3. Мутанты из Гессена
4. Мутанты из Москвы
5. Мутанты из Бетезды
B. Фенотипический анализ температурочувствительных мутантов
1. Предназначенность полипептидов относительно сегментов РНК
2. Мутанты с ts-повреждениями в сегменте 1 РНК
а) Активность транскриптазы вирионной РНК
б) Активность РНК-зависимой РНК-полимеразы экстрактов инфицированных клеток
в) Синтез вирусспецифической РНК in vivo
г) Синтез вирусспецифических   полипептидов
3. Мутанты с повреждениями в сегменте 2 РНК
а) Активность вирионной транскриптазы
б) Активность РНК-зависимой   РНК-полимеразы в экстрактах инфицированных клеток
в) Синтез вирусспецифической РНК in vivo
г) Синтез вирусспецифических полипептидов
4. Мутанты с повреждениями в сегменте 3 РНК
а) Активность транскриптазы вириона
б) Активность РНК-зависимой   РНК-полимеразы в экстрактах инфицированных клеток
в) Синтез вирусспецифической РНК in vivo
г) Синтез вирусспецифических   полипептидов
5. Мутанты с ts-повреждениями в сегменте 4 РНК
6. Мутанты с ts-повреждениями в сегментах РНК, кодирующих нуклеопротеид
а) Активность транскриптазы РНК
б) Синтез вирусспецифической РНК in vivo
в) Синтез вирусспецифических полипептидов
7. Мутанты с ts-повреждениями в сегменте РНК, кодирующем нейраминидазу
8. Мутанты с ts-повреждениями в сегменте 7 РНК
9. Мутанты с ts-повреждениями в сегменте 8 РНК
Г. Вакцины, полученные на основе   температурочувствительных мутантов
IV. Холодоадаптированные мутанты
V. Мутанты круга хозяев
A. Неусловные мутанты круга хозяев
Б. Условные мутанты круга хозяев
VI. Мутанты, устойчивые к амантадину
VII. Общие заключения
Структура дефектных интерферирующих РНК вируса гриппа и их прогениторных генов — Д. Нейяк, Н. Сивесабраманъян (D. Nayak, N. Sivasubramanian)
II. Свойства ДИ частиц вируса гриппа
III. РНК ДИ частиц вируса гриппа
IV. Структура генов и белков полимеразы
A. Последовательность нуклеотидов генов полимеразы
Б. Первичная структура белков РВ1 и РВ2
B. Предсказанные вторичные структуры белков РВ1 и РВ2
V. Структура ДИ РНК
А. Классы ДИ РНК
Б. Полные последовательности нуклеотидов ДИ РНК
VI. Генерирование ДИ РНК из прогениторных РНК
VII. Транскрипция ДИ частиц вируса гриппа
VIII. Интерференция ДИ вирусами гриппа
Вирусы гриппа В и гриппа  С — Г. Эйр, Р. Компанс (G. Air, R. Compans)
II. Вирус гриппа В
А. Разновидность РНК вируса гриппа В
Б. Белки вируса гриппа В
1. Гемагглютинин
2. Нейраминидаза
3. Матричный белок
4. Неструктурные белки
5. Белки Р
В. Репликация вируса гриппа В
Г. Эпидемиология
Д. Антигенная изменчивость вирусов гриппа В
III. Вирус гриппа С
A. Структура вируса
1. Морфология вирионов
2. Разновидности вирусной РНК
3. Вирусные полипептиды
4. Активности слияния и гемолиза
5. Фермент, разрушающий рецептор
Б. Репликация вируса гриппа С
B. Генетика и эпидемиология
Различия в патогенезе гриппозной инфекции, зависящие от вируса — Дж. Шульман (J. Schulman)
II. Методы
III. Различия биологических свойств, связанные с гемагглютинином
IV. Вирулентность для цыплят
V. Нейровирулентность для мышей
VI. Вирулентность для других экспериментальных животных
A. Хорьки
Б. Крысы
B. Мыши
VII. Вирусзависимые различия в других системах
A. Культуры клеток
Б. Выращивание вируса в эмбрионах
B. Чувствительность к амантадину
VIII. Вирулентность для человека
IX. Резюме
Молекулярная эпидемиология вируса гриппа — П. Пейлиз, Дж. Юнг (P. Palese, J. Young)
II. Вирусы гриппа А, В и С и связанные с ними заболевания
III. Грипп в XX столетии
IV. Надзор за вирусами гриппа
V. Вирусы H1N1, появившиеся в 1977 г
VI. Молекулярная эпидемиология гриппа у животных
VII. Механизмы, влияющие на изменчивость полевых штаммов вирусов гриппа
A. Точечные мутации
Б. Рекомбинация.
B. Делеции/вставки
Г. Повторное появление старых генов
VIII. Перспективы на будущее
Литература

скачать книгу: «Генетика вирусов гриппа»